Search results for "proteīnu kristalizācija"
showing 4 items of 4 documents
Laimas slimības ierosinātāja Borrelia burgdorferi ārējās virsmas proteīna BB0663 iegūšana un struktūras analīze
2019
Darba mērķis bija iegūt Laimas slimības izraisītāja Borrelia burgdorferi (B. burgdorgeri) celma B31 ārējās virsmas proteīna BB0663 struktūru un veikt šīs struktūras analīzi, lai iegūtu plašākas zināšanas par baktērijas patoģenēzes mehānismiem. Darba rezultātā BB0663 proteīns tika uzproducēts Escherichia coli šūnās, attīrīts un kristalizēts. Ar rengenstruktūranalīzes palīdzību tika iegūti šī kristāla difrakcijas dati. Izmantojot iegūtos datus, tika noteikta BB0663 proteīna 3D struktūra. Struktūras analīze parādīja, ka B. burgdorferi BB0663 proteīns ir līdzīgs baktērijas Novosphingobium aromaticivorans (N. aromaticivorans) proteīnam, kuram ir noteikta struktūra, bet nav zināma funkcija. Pētīj…
Ogļskābes anhidrāzes XII izoformas strukturālie pētījumi
2017
Ogļskābes anhidrāzes katalizē dzīvajos organismos būtisko bikarbonāta un ogļskābās gāzes savstarpējo atgriezenisko reakciju. Cilvēka organismā ir vairākas ogļskābes anhidrāžu izoformas, un dažu izoformu katalītiskā darbība ir nevēlama. Viena no šīm izoformām, ogļskābes anhidrāzes XII izoforma, saistīta ar vairāku ļaundabīgu audzēju attīstību. Maģistra darba iztrādē tika vairākkārtīgi uzlabota ogļskābes anhidrāzes XII izoformas ekspresijas un attīrīšanas sistēma un iegūtas vairākas ar ligandu saistītas ogļskābes anhidrāzes XII izoformas struktūras. Ar proteīnu rentgenstaru kristalogrāfijas palīdzību tika identificētas dažādu inhibitoru konformācijas ogļskābes anhidrāzes XII izoformas aktīvaj…
Modificētās L-ornitīna δ-aminotransferāzes strukturālie pētījumi jaunu diazonamīda A struktūranalogu dizainam
2015
Darba mērķi ir izstrādāt metodi rekombinantas modificētās ornitīna δ-aminotransferāzes (MOAT) produkcijai un kristalizēšanai, analizēt MOAT strukturālās atšķirības no ornitīna δ-aminotransferāzes (OAT), kā arī noteikt MOAT kristālu struktūru kompleksā ar Latvijas Organiskās sintēzes institūta pētnieku sintezētajiem diazonamīda A struktūranalogiem. Tādejādi, varētu noteikt MOAT un diazonamīda A struktūranalogu ķīmisko mijiedarbību veidu, iegūstot zināšanas jaunu MOAT inhibitoru dizainam. Bakalaura darba laikā tika iegūts rekombinants, E.coli producēts, MOAT, kā arī MOAT kristālstruktūra kompleksā ar piridoksāla 5´ fosfātu. Bakalaura darbs tika izstrādāts Latvijas Biomedicīnas pētījumu un stu…
Borrelia burgdorferi celma B31 virsmas proteīna BBA68 struktūras noteikšana un analīze
2015
Borrelia burgdorferi ir spirohetu dzimtas baktērija, kura izraisa Laima slimību. Lai izvairītos no saimniekorganisma imūnajām reakcijām, B. burgdorferi ir izveidojies komplicēts gēnu regulācijas mehānisms, kur liela nozīme ir ārējās virsmas proteīniem. Darba mērķis bija ar rentgenstruktūranalīzes palīdzību noteikt B. burgdorferi celma B31 ārējā virsmas proteīna BBA68 trīsdimensiālo struktūru, un analizēt strukturālās atšķirības no B. burgdorferi celma ZS7 ārējā virsmas proteīna BbCRASP-1. Strukturālie pētījumi ļauj prognozēt proteīnu funkcijas, tādā veidā gūstot plašāku ieskatu par B. burgdorferi baktērijas mehānismiem Laima slimības patoģenēzē. Pētījumā sekmīgi tika iegūts proteīna BBA68 r…